La rue du Docteur-Goujon est une voie du 12e arrondissement de Paris, en France. Elle est située dans le quartier de Picpus.
La rue est accessible par les lignes 6 et 8 à la station Daumesnil.
Elle porte le nom du docteur Étienne Goujon (1839-1907), médecin, sénateur du département de l'Ain et maire du 12e arrondissement de 1879 à 1900.
Cette voie est ouverte sous sa dénomination actuelle en 1926 puis est classée dans la voirie de Paris par arrêté du .
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