孫應魁(?—?),字元之,直隸松江府上海縣人,民籍,明朝政治人物。
應天府鄉試第九十八名舉人。嘉靖二十九年(1550年)中式庚戌科三甲第二百零四名進士。
曾祖孫寅,七品散官;祖父孫鶚,刑部司務;父孫繼科,監生。母劉氏。
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