黃曰謹(?—?),字元祇,福建漳州府鎮海衛軍籍,明朝政治人物。
福建鄉試第三十八名,萬曆五年(1577年)丁丑科會試第二十五名,登三甲第一百八十二名進士。
曾祖黃德乾;祖父黃璇宗;父黃繼傳。母李氏。
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